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基于基因组技术——改善乳腺癌治疗的更好分类法

来源:互联网  时间:2018-02-03
摘要:摘要:这一系统的细节和精度,可能对乳腺癌研究人员具有广泛的用处,他们将能够调查之所以某类癌症对某些治疗方法反应较好的原因,以便寻找乳腺癌的临床标记,或发现其新的治疗靶点。最近,根据科学家开发出的一种新
摘要:这一系统的细节和精度,可能对乳腺癌研究人员具有广泛的用处,他们将能够调查之所以某类癌症对某些治疗方法反应较好的原因,以便寻找乳腺癌的临床标记,或发现其新的治疗靶点。

  最近,根据科学家开发出的一种新工具,可以将乳腺癌分类为十种不同的亚型。相关研究结果发表在2014年8月28日的《GenomeBiology》杂志,有望改善这种疾病的治疗效果。

  癌症的产生,是因为遗传变化致使正常细胞发展为肿瘤。随着我们对乳腺癌的了解增多,我们知道,这不是一种单一的疾病——引起不同类型癌症的基因突变是不一样的,这就是为什么肿瘤对治疗的反应有所差异,为什么它们会以不同的速度生长。目前,有两个关键的指标,临床医生用其来预测治疗疗效。

  发现肿瘤遗传学的研究动态,并创建一种系统来诊断肿瘤类型,是癌症科学家们的一个主要目标。为此,英国癌症研究所和剑桥大学的研究人员,开发了IntClust系统,该系统利用基因组技术来创建一种分类系统,该分类系统具有足够的细节,能够更准确地指出患者得的是哪种类型的乳腺癌,从而确定哪种治疗方法将是最合适的。

  为了检测这个系统,科学家们分析了他们开发系统所用的997份肿瘤样本,以及来自公共数据库的7544份样本,连同基因组和临床数据,包括来自TheCancerGenomeAtlas的数据。他们使用IntClust系统和今天使用的两个主要系统:PAM50,其将癌症分成五种类型;和SCMGENE,其将癌症分成4种类型,对这些数据进行分类。

  他们发现,至少在预测患者预后和治疗疗效方面,IntClust与现有的系统无异。但是这个系统只在3.1%具有较差存活率的女性当中,识别出一个以前没有注意到的子群,这些患者似乎对治疗具有抵抗性。识别这一患者组的基因组标签,就能够在早期标记这些高风险的癌症,获得这一组患者的基因组数据,就可能有助于研究新的方法,治疗这种类型的癌症。

  目前,利用该系统对肿瘤进行分类,对于大多数临床医生还是昂贵的,并且,解释这些结果业需要许多临床设置达不到的训练。但是,这一系统的细节和精度,可能对乳腺癌研究人员具有广泛的用处,他们将能够调查之所以某类癌症对某些治疗方法反应较好的原因,以便寻找乳腺癌的临床标记,或发现其新的治疗靶点。

  本文第一作者、英国癌症研究所的RazaAli称:“我们开发了一种基于表达的方法,将乳腺肿瘤分类成IntClust亚型。我们的研究结果强调了这一方法在靶向治疗时代的潜力,为将肿瘤分为IntClust亚型的新一代临床试验,奠定了基础。”

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